Viện Khoa học Công nghệ Ứng dụng được thành lập với chức năng đào tạo, nghiên cứu khoa học và chuyển giao công nghệ trong các lĩnh vực Nông nghiệp công nghệ cao, Công nghệ thực phẩm ứng dụng, Công nghệ sinh học, Môi trường. Viện đã ký kết hợp tác đào tạo nhân lực chất lượng cao với Khu Nông nghiệp Công nghệ cao Tp. HCM, Trung tâm Công nghệ Sinh học Tp. HCM,  Tập đoàn GNT – Mạng lưới công nghệ toàn cầu Nhật Bản, Tập đoàn CJ – Cầu Tre tại Việt Nam, Vườn Ươm Công nghệ Việt Nam Hàn Quốc (KVIP), …